财政部没有及时批复文教科学事业费等支出预算，一些司局和个人利用职权动用财政资金办公司、建楼堂馆所。15个省级国税局查出违法违规金额47．70亿元。18个直属海关擅自降低税率批准减免税，违法违规金额16．6亿元。18个省级分库查出违法违规金额16．06亿元。水利部隐瞒转移南水北调资金，设立“小金库”吃利息；挪用水利专项资金购置办公楼及宿舍甚至炒股票。国务院53个部门和直属单位查出违法违规金额164．05亿元；国家旅游局所属中国旅游国际信托投资有限公司私分国债收益人均12万元，董事长一人分得77万元。
当一个接一个“相当严重”的问题抛出来时，人们的心情沉重起来，但同时，委员们也对审计署的工作成绩给予了认可。当李金华的报告结束后，议事大厅里响起热烈的掌声，久久不息。众多常委会委员都说，“这是多年来审计报告中最好的一个”。
谢安山委员说，责任人对有关问题一定要交代清楚，挪用水利专项资金，在古代要杀头的，我们应根据国家法律予以严肃惩处。宋清渭委员说，审计报告中提出的问题，不能就这么算了，不要讲情面，应该以铁的决心、铁的手腕、铁的纪律来整顿、治理财政工作。四川大学副校长刘应明委员认为，对去年的社会捐助的救灾款物应查个清楚明白。柳随年委员建议，账必须细化。他说，每次报告上总有一项“其他”，占据千亿元资金，这个“其他”的字样应不允许再出现，“否则便如同黑箱操作”。
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